1.Thiết bị

• Hệ thống chia thành hai phần A, B hoạt động độc lập
• Sức chứa: 2 flow cell
• Flow cell có 2 lane chạy, cho phép chạy 2 chương trình giải trình tự khác nhau cùng lúc
• Dữ liệu đầu ra
  - Cao: 1.5 tỷ read mỗi flow cell
  - Trung bình: 750 triệu read mỗi flow cell
  - Thấp: 375 triệu read mỗi flow cell
• Độ chính xác
  - >90% Q30 với kit 2x150 và 2x75 chu kỳ
  '- >85% Q30 với kit 2x300 chu kỳ
  - >70% Q50 với kit Cloudbreak UltraQ
• Thời gian giải trình tự:
  <=24 giờ: kit 2x75 chu kỳ
  <=38 giờ: kit 2x150 chu kỳ
  <=60 giờ: kit 2x300 chu kỳ
• Cho phép tải trực tiếp thư viện thẳng vào flow cell với kit Cloudbreak Freestyle
• Có nền tảng đám mây ElemBio Cloud để quản lý dữ liệu

2. Quy trình Trinity

• Quy trình giải trình tự mục tiêu truyền thống là một quy trình kéo dài gồm nhiều bước rửa cần kiểm soát nhiệt độ, khuếch đại bằng PCR và kiểm tra chất lượng thư viện
  Với quy trình Trinity, chỉ cần thực hiện bước lai DNA với đầu dò mục tiêu sau đó nạp trực tiếp lên hệ thống giải trình tự AVITI24, các bước sau lai và cả giải trình tự sẽ được thực hiện tự động trên hệ thống
• Tiết kiệm >= 5 giờ thao tác thủ công
• Hỗ trợ quy trình lai nhanh với thời gian 1 giờ cho phép thực hiện toàn bộ quy trình từ chuẩn bị thư viện đến giải trình tự trong vòng 1 ngày
• Chất lượng dữ liệu: >=90% Q30
• % On-Target: >=85%
• Fold 80: <=1.5
• Thời gian máy chạy (bao gồm các bước sau lai probe và giải trình tự)
  Kit 2x75: 24 giờ
  Kit 2x150: 38 giờ
• Độ bao phủ trung bình (24 mẫu):
  Kit 2x75: >=30X
  Kit 2x150: >=50X
• Ứng dụng: giải trình tự toàn bộ exome và các panel probe tùy chọn

3.Công nghệ giải trình tự Avidity

• Phương pháp nhân bản: nhân bản xoay vòng (RCA), chỉ nhân bản các phân tử DNA đã đóng vòng, không cần PCR, tạo thành các polonies. Mỗi polony chứa hàng trăm bản sao của đoạn thư viện ban đầu.
• Công nghệ ABC (Avidity) sử dụng các phân tử ái lực (Avidite) để thực hiện phản ứng giải trình tự hiệu quả và tạo ra dữ liệu có độ chính xác cao. Tỷ lệ tín hiệu trên nhiễu mạnh, duy trì được ngay cả trong điều kiện mật độ polony cao, là yếu tố then chốt đảm bảo độ chính xác của dữ liệu
• Ở mỗi chu kỳ giải trình tự, enzyme polymerase sẽ liên kết phân tử avidite với polony và primer duplex, sau đó avidite đặc hiệu sẽ được giữ chặt tại base tương ứng. Kết quả tạo thành 1 phức hợp bền chặt, cho phép giảm nồng độ hóa chất xuống 100 lần so với phương pháp giải trình tự bằng tổng hợp (sequencing-by-synthesis, SBS)
• Phương pháp nhân bản chỉ sử dụng mạch gốc để tránh tích luỹ lỗi do nhân bản, hạn chế tác động của index hopping và optical duplicate

4.Chức năng phân tích đa nền tảng Cytoprofilling

Phân tích: RNA, protein, hình thái tế bào

'- RNA: lên đến 350 mục tiêu

'- Protein: lên đến 50 mục tiêu

'- Hình thái: 6 mục tiêu

Giải trình tự trực tiếp (in situ) 100 bp RNA

Panel thiết kế sẵn:

'- MAP Kinase cell cycle

'- MAP Kinase và Apoptosis

'- Miễn dịch học

'- Khoa học thần kinh.

Danh mục mục tiêu tùy chọn lên tới 88 proteins

Chụp ảnh: độ phân giải không gian dưới tế bào <250 nm

Dạng tế bào thích hợp: tế bào bám chính, huyền phù tế bào

Công suất: tối đa 1 triệu tế bào với vùng 10cm2 mỗi flow cell, 2 flow cells hoạt động độc lập mỗi mẻ chạy

Định dạng

'- 48 giếng

'- 12 giếng (0.5 cm2/giếng)

'- 1 giếng (10 cm2/giếng)

Thời gian giải trình tự: 24 giờ

Chuẩn bị mẫu: 45 phút

5.Công nghệ phân tích đa nền tảng (multiomics)

• Hóa chất Teton cho phép phân tích RNA, protein và hình thái tế bào sử dụng phương pháp phát hiện các probe đặc hiệu và kháng thể kết hợp với công nghệ giải trình tự ABC để đo lường biểu hiện RNA, protein với độ phân giải dưới tế bào trong từng tế bào riêng lẻ
• Kỹ thuật nhuộm tế bào độc quyền cung cấp hình ảnh của màng tế bào, nhân tế bào, ty thể và các bào quan khác.
• Việc phân đoạn tế bào được thực hiện dựa trên các đặc điểm hình thái tế bào kết hợp với các mô hình học máy đã được xác thực trên nhiều loại tế bào khác nhau, đảm bảo việc gán RNA và protein chính xác cho từng tế bào
• Hệ thống  AVITI24 có thể phát hiện hàng nghìn bản sao RNA trên mỗi tế bào và hàng tỷ bản sao RNA chất lượng cao tại chỗ (in situ) trên một flow cell Teton, giúp phát hiện các gene với nhiều mức độ biểu hiện khác nhau với độ nhạy cao, hỗ trợ phân loại tế bào chi tiết và phân tích các con đường sinh học.
• Phần mềm phân tích được tích hợp sẵn vào hệ thống cho phép phân đoạn tế bào, gán các đặc điểm phân tử như RNA, protein vào từng tế bào, báo cáo hình thái học tế bào