Hình 1. Các microarray Agilent SurePrint HT CGH mới bao gồm lựa chọn 16x 25k CGH và CGH+SNP, dành cho dữ liệu phân tích có độ phức tạp thấp như sàng lọc toàn bộ bộ gen và tùy chọn 24x 13k CGH, dành cho dữ liệu phân tích tập trung với công suất cao, chẳng hạn như sàng lọc số lượng bản sao có độ phân giải cao.

Một giải pháp đáng tin cậy, nhanh chóng, linh hoạt cho nghiên cứu của bạn

SurePrint HT CGH Microarray là một phần của quy trình Agilent microarray, cung cấp giải pháp hoàn chỉnh từ mẫu đến kết quả, bao gồm bộ kit gắn nhãn HT chuyên dụng mới, miếng đệm, buống lai và khả năng tương thích hoàn toàn với phần cứng hiện có.

Hình 2. Quy trình làm việc Agilent SurePrint HT CGH microarray, từ mẫu đến kết quả.

Lợi ích của quy trình làm việc bao gồm:

• Linh hoạt: sử dụng Agilent SureScan và SureScanDx, HybOven, Chambers và HybStation hiện có mà không cần thay đổi phần cứng.

• Sự đơn giản: sử dụng các hóa chất tương tự như array CGH hiện có của bạn để quản lý việc đặt hàng đơn giản hơn.

• Khả năng tương thích: array tương thích với phần mềm Agilent Feature Extraction 12.2 và CytoGenomics 5.3

• Hiệu quả: phương pháp tinh sạch dựa trên hạt, sẵn sàng tự động hóa và tạo điều kiện xử lý hợp lý nhiều mẫu với độ tái lập cao.

Bộ kit gắn nhãn mới Agilent SureTag HT labeling kits cung cấp khả năng tinh sạch mẫu cải tiến, đơn giản hóa bằng cách sử dụng các hạt nano độc quyền của Agilent và không yêu cầu bước cô quay chân không, cho phép xử lý hiệu quả và đảm bảo các yêu cầu về thể tích. Bộ kit sẵn sàng cho triển khai trên các nền tảng xử lý chất lỏng tự động để tăng công suất và cải thiện độ tái lập. Bộ kit sẽ có sẵn ở hai định dạng, có và không có DNA tham chiếu đi kèm, và có đủ hóa chất để xử lý 96 mẫu cho cả array 16x và 24x.

Hình 3.Trên nhiễm sắc thể số 3 (Chr3), mẫu này hiển thị việc mất đoạn 74,8 Mb (3p25.3p12.1) với tỷ lệ log2 là -0,27, cho thấy việc mất đoạn này xảy ra ở một phần của tế bào khối u. Các đầu dò SNP xác nhận việc mất đoạn. Ngoài ra, nó hiển thị mức thêm đoạn 35,5 Mb (3q24q26.33) cũng được xác nhận bởi các đầu dò SNP.

Hinh 4. Chế độ xem Gen view trong phần mềm Cytogenomics của mẫu Breast FF được thử nghiệm trên cả thiết kế CGH 16x và 24x. Ở bảng bên trái có thể nhìn thấy một cửa sổ 4 Mb xung quanh một CNV (mất) trên Chr2. Bảng bên phải là ảnh phóng to xung quanh gen NPHP1, cả hai thiết kế đều phát hiện việc mất đoạn.

Cải thiện quy trình làm việc công cụ xử lý mẫu mới

Xử lý mẫu một cách dễ dàng và đạt được kết quả có độ lặp lại trong khi giảm bớt yêu cầu về đào tạo với Agilent HybStation, một công cụ hỗ trợ nạp mẫu mới cung cấp quy trình chuẩn bị mẫu microarray nhất quán và dễ dàng.

Hình 5. Agilent HybStation cung cấp một công cụ thuận tiện và ổn định để xử lý hiệu quả các microarray.

• Được thiết kế để mang lại sự ổn định, giảm thiểu lỗi trong mỗi bước, giải quyết sự sai lệch trong các bước nạp array
• Nhằm hỗ trợ lắp ráp các buồng lai microarray Agilent trước khi ủ trong tủ lai, tăng tính đơn giản và khả năng tái lặp của quy trình

Nội dung có thể điều chỉnh để phân tích tập trung

Hai định dạng microarray mới, 16x và 24x (Hình 1), có thể được thiết kế dễ dàng thông qua công cụ trang web trực tuyến của chúng tôi. Chọn vùng quan tâm trong danh mục hiện có hoặc sử dụng tính năng của trình hướng dẫn thiết kế để hướng dẫn bạn trong quá trình thiết kế. Để biết thêm thông tin hãy truy cập https://earray.chem.agilent.com/suredesign.  Ba array mới cung cấp sự kết hợp độc đáo giữa công suất, nội dung và giá cả, xóa bỏ khoảng cách giữa PCR đa kênh (không đủ điểm dữ liệu) và NGS/ microarrays (đắt/phức tạp). Các slide đã được tối ưu hóa để có được sự cân bằng giữa đa kênh trên slide và nội dung nhằm mang lại sự linh hoạt tối đa trong thiết kế của khách hàng.

Thông số kỹ thuật của SurePrint HT CGH Microarrays

Thông tin đặt hàng

Hóa chất bổ sung