Hồ sơ giải mã gene toàn diện với Xét nghiệm ung thư SureSelect CGP

Đăng bởi Ha Huynh - (Theo Agilent Technologies) - 04/13/2023

Khai thác toàn bộ tiềm năng của hồ sơ giải mã gene toàn diện (CGP) giúp nâng cao khả năng điều trị ung thư chính xác với bộ assay ung thư SureSelect CGP, bộ probe được thiết kế nhằm mục tiêu nghiên cứu ung thư dựa trên công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS). Với danh sách gene được chọn lọc từ sự tư vấn của các nhà nghiên cứu ung thư hàng đầu và rút ra từ các hướng dẫn lâm sàng đã được chứng thực, các thử nghiệm lâm sàng đang diễn ra và cơ sở dữ liệu ung thư soma, cho phép truy cập vào danh mục những dấu ấn sinh học cập nhật nhất và phù hợp nhất về mặt lâm sàng
In trang

Bộ assay Ung thư SureSelect CGP


Xét nghiệm SureSelect Cancer CGP cung cấp khả năng giải trình tự DNA và RNA song song giúp phát hiện các kiểu biến đổi soma chính bao gồm đột biến nucleotide đơn (SNV), biến thể số bản sao (CNV), chèn/xóa (indel), chuyển vị (TL) ; dấu ấn sinh học ung thư miễn dịch, mức độ đột biến khối u (TMB) và bất ổn định vi vệ tinh (MSI); và dung hợp gen RNA. Tự tin về kết quả với hiệu suất cao được tối ưu hóa sử dụng mã vạch phân sửa lỗi (molecular barcode), phân mảnh bằng enzyme thuận tiện và lượng mẫu đầu vào tối thiểu. Quy trình làm việc có thể chỉnh sửa phù hợp nhu cầu của phòng thí nghiệm với các tùy chọn để kết hợp các giải pháp phân tích dữ liệu, tự động hóa và QC mẫu.






Lai tạo nhanh


Chỉ 90 phút để thu giữ các đoạn mục tiêu, cho phép quy trình làm việc nhanh hơn. Các thư viện sẵn sàng giải trình tự trong 9h


Mã vạch phân tử sửa lỗi (Molecular barcode)


Unique molecular identifiers (UMI) phát hiện các alen biến thể tần số thấp với độ nhạy và độ chính xác cao và unique dual index (UDI) cải thiện hiện tượng index hopping


Phân mảnh bằng enzyme


Phân mảnh bằng enzyme giúp loại bỏ sự cần thiết của thiết bị cắt vật lý. Thuận tiện tối ưu, nâng cao độ phức tạp của thư viện và độ bao phủ


Lượng mẫu đầu vào thấp


Bắt đầu với ít nhất là 10 ng (khuyến nghị 50 ng) đến 200 ng axit nucleic từ mẫu mô FFPE hoặc mô tươi đông lạnh,


 


Quy trình NGS linh hoạt



Kết quả thu được các thư viện NGS có độ phức tạp cao với quy trình làm việc linh hoạt và hiệu quả. Có thể sử dụng hệ thống chuẩn bị thư viện tự động và làm giàu mục tiêu để chuyển từ QC mẫu axit nucleic sang kết quả giải trình tự trong vòng chưa đầy bốn ngày. Mẫu có thể được giải trình tự trên hệ thống Illumina NextSeq, HiSeq và NovaSeq. Phân tích dữ liệu, đánh giá các biến thể liên quan lâm sàng ngày trong phòng thí nghiệm của bạn


QC mẫu & thư viện


Kết quả chất lượng cao phụ thuộc vào mẫu đầu vào chất lượng cao. Hệ thống Agilent TapeStation là giải pháp điện di tự động dùng kiểm soát chất lượng của nhiều loại mẫu DNA và RNA. Công nghệ ScreenTape đã được chứng minh cho thấy tính dễ sử dụng vượt trội và cho phép phân tích kích thước, số lượng và tính toàn vẹn của mẫu.


Biobanking Issues: Challenges, Instruments, and Solutions


Tự động hóa quá trình chuẩn bị thư viện và làm giàu mục tiêu


Chuẩn bị các thư viện chất lượng cao, sẵn sàng giải trình tự với tính nhất quán và hiệu quả sử dụng phòng thí nghiệm cao hơn bằng giải pháp tự động hóa để chuẩn bị thư viện và làm giàu mục tiêu. Chọn giữa hai hệ thống tự động hóa từ Agilent, cả hai đều hỗ trợ quá trình phân mảnh DNA bằng enzyme, phiên mã ngược từ RNA và làm sạch hạt. Các hệ thống tự động hóa này cung cấp chương trình đặt máy với điều kiện sử dụng hoá chất SureSelect


Magnis NGS Prep System | Agilent


Magnis NGS Prep là một hệ thống để bàn hoàn toàn tự động, dễ sử dụng, yêu cầu tối thiểu về nhân lực và chuyên môn về NGS để vận hành. Hoá chất được định lượng trước và chương trình chạy được thiết lập sẵn cho phép thời gian cài đặt chỉ 15 phút. Các chức năng đảm bảo chất lượng tích hợp bao gồm đèn UV để khử nhiễm giữa các lần chạy và quét mã vạch tự động để đặt vật tư tiêu hao chính xác. Hệ thống Magnis NGS Prep có thể chuẩn bị tối đa 8 thư viện mỗi lần chạy và tối đa hai lần chạy mỗi ngày.


Automatic sample preparation system - HT NGS - Agilent Technologies - Life  Sciences and Chemical


Bravo NGS là hệ thống xử lý chất lỏng để tăng thông lượng, cho phép người dùng mở rộng quy mô và chuẩn bị đồng thời tới 96 thư viện, trong khi vẫn duy trì khả năng tái tạo và chất lượng. Nền tảng tự động hóa mở cung cấp cho người dùng sự linh hoạt trong các ứng dụng để điều chỉnh và tối ưu hóa các thử nghiệm khác trong quá trình phát triển.


Giải pháp phân tích dữ liệu


Có thể thực hiện phân tích dữ liệu cho Xét nghiệm Ung thư SureSelect CGP bằng cách sử dụng phần mềm tự thiết kế hoặc từ một nhà cung cấp khác*, cũng như phần mềm Alissa Interpret của Agilent hỗ trợ ra quyết định lâm sàng thành thạo và đáng tin cậy.


Alissa Interpret Case Study - PDF Free Download


Alissa Intepret là một phần mềm báo cáo và diễn giải dữ liệu, là một phần của Nền tảng tin học lâm sàng Alissa. Phần mềm này cung cấp quyền truy cập trực tiếp vào các CSDL cập nhất nhất chứa thông tin về các dấu ấn sinh học, thử nghiệm lâm sàng và liệu pháp điều trị. Alissa Interpret nâng cao hiệu suất và năng suất, đồng thời giảm thời gian xoay vòng bằng cách xây dựng và tự động hóa quy trình đánh giá biến thể, cho phép phân loại và quản lý hiệu quả các biến thể soma có liên quan về mặt lâm sàng, đồng thời tạo báo cáo toàn diện và đáng tin cậy.


Bảng 1. Danh sách gen DNA trong Xét nghiệm Ung thư SureSelect CGP




Bảng 2: Danh sách gene RNA trong Xét nghiệm Ung thư SureSelect CGP


Để được tư vấn thêm, liên hệ: ha.hn@uscivn.com (Ms.Hà) hoặc marketing@uscivn.com
Để nhận báo giá, liên hệ: sales@uscivn.com
Tin liên quan: Sinh học phân tử
Giải trình tự bộ gen với công nghệ "On-flow cell weighted low pass" giúp đơn giản hóa và đẩy nhanh quy trình chọn giống trong nông nghiệp
Hướng đến sự đơn giản - Next Generation HT custom CGH microarray (P2)
Hướng đến sự đơn giản - Next Generation HT custom CGH microarray
Droplet Digital PCR (ddPCR): Ký tự d nhỏ mang đến khác biệt lớn
Sàng lọc gen trên Chim Sẻ Vằn một cách dễ dàng
Theo dõi chất lượng trị liệu CAR T-cell với Droplet Digital PCR
Cải thiện việc kiểm soát chất lượng trong sản xuất CAR T-Cell với công nghệ Droplet Digital™ PCR
Máy đọc vi giọt QX600
QC mẫu FFPE bằng hệ thống TapeStation (Agilent) cho hệ thống giải trình tự MGISEQ-2000
CHƯƠNG TRÌNH GIVE AWAY TRỌN GÓI ROBOT THAO TÁC CHẤT LỎNG ASSIST PLUS VÀ MÔ ĐUN PIPET ĐƠN KÊNH D-ONE! - INTEGRA Biosciences



Những bản tin khác: