Sự kết hợp tối ưu giữa chi phí, chất lượng và hiệu suất phù hợp với mọi ứng dụng giải trình tự ở mọi quy mô
Giải trình tự thế hệ mới (NGS) đã cách mạng hóa lĩnh vực hệ gen, giúp các nhà nghiên cứu giải quyết các câu hỏi khoa học phức tạp bằng các công nghệ và công cụ hỗ trợ ngày càng phát triển. Cung cấp góc nhìn chưa từng có về DNA, NGS thúc đẩy khám phá khoa học trên toàn cầu. Mặc dù có rất nhiều cải tiến, nhưng giá thành để giải trình tự vẫn còn cao, đòi hỏi năng suất ở quy mô công nghiệp mới có thể tiết kiệm chi phí. Việc hạ thấp chi phí thường phải đi kèm với giảm chất lượng và tính linh hoạt. Nhiều phòng thí nghiệm chuyển sang giải pháp thuê bên ngoài, chấp nhận chậm trễ để có được chi phí thấp hơn. Để khắc phục các tình trạng này và thúc đẩy khoa học phát triển hơn, hệ thống Element AVITI mô phỏng lại các thành phần cốt lõi của NGS để cung cấp một hệ thống để bàn nhỏ gọn cho phép truy cập vào hệ sinh thái gen.
Cung cấp công suất linh hoạt với chi phí đặc biệt thấp, hệ thống AVITI tiết kiệm thời gian và nguồn lực mà không cần phải phân đợt chạy hoặc chấp nhận chất lượng kém hơn. Avidity Sequencing™ tạo thành cốt lõi của một thiết kế đột phá, dễ dàng thích ứng với mọi ứng dụng, cung cấp các phương pháp có thể mở rộng từ amplicon đến toàn bộ bộ gen và từ giải trình tự đoạn ngắn đến giải trình tự đoạn dài.
Thiết kế thí nghiệm có thể mở rộng
Dù thí nghiệm cần 2 tỷ lượt đọc hay chỉ 100 triệu lượt đọc mỗi lần chạy, hệ thống AVITI đều có thể thực hiện giải trình tự chất lượng cao, tiết kiệm chi phí trên quy mô rộng. Nhiều cấu hình bộ kit giải trình tự từ độ dài đọc 2 x 75 đến 2 x 300 và đầy đủ các đầu ra bộ gen hiệu chuẩn cao, trung bình và thấp mà không làm giảm hiệu quả chi phí, ngay cả ở quy mô nhỏ (Bảng 1). Bộ kit hỗ trợ nhiều kích cỡ chèn (insert) đồng thời cho phép kết hợp index kép (UDI) và các đoạn định danh phân tử (UMI).
Các làn riêng lẻ cho phép kiểm soát nhiều hơn trên mẫu và dòng thời gian, cung cấp khả năng tách nhóm thư viện trong một làn hoặc sắp xếp thứ tự hai nhóm thư viện trên một flow cell mà không cần bộ kit giải trình tự bổ sung.
Hóa chất Cloudbreak™
Hóa chất Cloudbreak cải tiến công nghệ Avidity Sequencing cốt lõi với độ chính xác, hiệu quả và tốc độ cao hơn. Chỉ trong 38 giờ, hai lần chạy 2 x 150 với indexing tạo ra ≤ 600 Gb dữ liệu và 2 tỷ lượt đọc. Thời gian chạy quay vòng được tăng tốc giúp tối đa hóa đầu ra trình tự tiềm năng trong một ngày làm việc thông thường, cho phép hoàn thành tối đa hai lần chạy 2 x 75 mỗi ngày.
Hiệu suất dẫn đầu
Hệ thống AVITI đặt lại kỳ vọng về điểm chất lượng (điểm Q), ở ≤ 300 chu kỳ mang lại thông số kỹ thuật chính xác nhất hiện nay với > 90% base đạt điểm Q30.¹ Bộ kit 2 x 300 đạt > 80%. Điểm Q vượt quá Q40 là kết quả dễ dàng đạt được. Đánh giá về chất lượng dữ liệu đã kết luận rằng trên tất cả phạm vi bao phủ 20–50x, hệ thống AVITI đã chứng minh độ chính xác cao hơn so với công nghệ giải trình tự cũ. Dữ liệu của hệ thống AVITI có ít lần đọc soft-clipped hơn ở các vùng homopolymer khó và vùng lặp lại, cùng với những lợi thế rõ ràng khác.
Chi tiết vui lòng tải brochure
Các thông số hiệu năng chủ chốt
Nhiều lựa chọn kit giải trình tự đáp ứng phổ rộng các ứng dụng và xét nghiệm quy mô lớn, giúp tiết kiệm chi phí nhưng vẫn đảm bảo chất lượng dữ liệu đầu ra. Hiệu năng cao, một lần chạy 2 x 150 kèm index tạo ra đến 600 GB dữ liệu và 2 tỷ read chỉ trong 38 giờ.
Đầu ra giải trình tự và thời gian chạy
|
Kit 2 x 75
|
Kit 2 x 150
|
Kit 2 x 300
|
Flow Cell
|
Đầu ra
|
Thời gian
|
Đầu ra
|
Thời gian
|
Đầu ra
|
Thời gian
|
Đầu ra thấp
|
|
|
75 GB
|
27 giờ
|
|
|
Đầu ra vừa
|
75 GB
|
20 giờ
|
150 GB
|
31 giờ
|
60 GB
|
51 giờ
|
Đầu ra cao
|
150 GB
|
24 giờ
|
300 GB
|
38 giờ
|
180 GB
|
60 giờ
|
Lượng read và điểm chất lượng (quality score)
|
Kit 2 x 75
|
Kit 2 x 150
|
Kit 2 x 300
|
Flow Cell
|
Lượng read
|
Q30
|
Lượng read
|
Q30
|
Lượng read
|
Q30
|
Đầu ra thấp
|
|
|
250 triệu
|
|
|
|
Đầu ra vừa
|
500 triệu
|
> 90%
|
500 triệu
|
> 90%
|
100 triệu
|
> 85%
|
Đầu ra cao
|
1 tỷ
|
> 90%
|
1 tỷ
|
> 90%
|
300 triệu
|
> 85%
|
Thông số kỹ thuật
- Read pairs PF/flow cell: ≥ 1 tỷ
- Độ dài read tối đa: 2 x 300 bp với index kép và hỗ trợ UMI
- Flow cell kép
- Phần mềm điều hành AVITI với màn hình cảm ứng
- Hệ điều hành Ubuntu Core 20.04 LTS
- Môi trường vận hành
- Nhiệt độ: 18 – 26°C
- Độ cao: < 2000 m
- Độ ồn: ≤ 62 db tại 3,3 ft
- Kích thước thiết bị: (C x N x S): 29,5 x 37,6 x 28,5 in
- Trọng lượng: 155,1 kg/342 lb
- Nguồn điện: 100 – 240 VAC, 50/60 Hz, 15 A, 550 W (trung bình)